В 1994 г. окончил среднюю школу № 59 г. Пензы с золотой медалью.

В 1999 г. окончил естественно-географический факультет Пензенского государственного педагогического университета им. В.Г. Белинского, получив диплом с отличием.

В 1999–2002 гг. обучался в очной аспирантуре Биологического факультета Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова по специальности «Гидробиология» и в феврале 2002 г. защитил диссертацию на соискание учёной степени кандидата биологических наук

С 2002 по 2008 г. – старший преподаватель, доцент Пензенского государственного педагогического университета им. В.Г. Белинского.

В июне 2007 г. присвоено ученое звание доцента по кафедре зоологии и экологии.

В марте 2008 г. защитил диссертацию на соискание учёной степени доктора биологических наук по специальностям «Экология» и «Гидробиология» на Биологическом факультете Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова.

С мая 2008 г. и по настоящее время работает профессором кафедры зоологии и экологии.

В марте 2010 г. присвоено ученое звание «профессор» по кафедре зоологии и экологии.

С сентября 2008 г. по июль 2011 г. – начальник управления науки, инноваций и послевузовского образования;

с июля 2011 г. по октябрь 2012 г. – проректор по учебной работе Пензенского государственного педагогического университета им. В.Г. Белинского.

В декабре 2012 г. назначен проректором по международной деятельности Пензенского государственного университета.

Руководит аспирантурой по специальности 03.02.08 – «Экология», магистерской программой «Экология» по направлению 020400.68 «Биология».

Направления научных исследований:

структурно-функциональная организация биологических сообществ в разных масштабах пространства-времени;
экология и систематика свободноживущих раковинных амеб, инфузорий и гетеротрофных жгутиконосцев;
экология сообществ почвенных животных, морского зообентоса, пресноводного зоопланктона.

В период 2004–2011 гг. руководил 12 грантами РФФИ (в том числе совместными российско-китайским и российско-украинским проектами), двумя грантами Президента РФ для молодых ученых – кандидатов (2006–2007 гг.) и докторов (2010–2011 гг.) наук, двумя государственными контрактами в рамках ФЦП "Научные и научно-педагогические кадры инновационной России" (мероприятие 1.2.1).

В 2012 г. руководит тремя грантами РФФИ (в том числе совместным российско-индийским проектом), грантом Президента РФ для молодых ученых – докторов наук (2012–2013 гг.) и одним государственным контрактом в рамках ФЦП "Научные и научно-педагогические кадры инновационной России" (мероприятие 1.2.1).

Организатор Второй Всероссийской (с международным участием) полевой школы по почвенной зоологии и экологии для молодых ученых (Пенза, 12–17 сентября 2011 г.), проведенной при финансовой поддержке РФФИ.

Участник 56-го рейса научно-исследовательского судна (НИС) «Профессор Штокман» в Баренцевом море (сентябрь – октябрь 2003 г.) и 54-го рейса НИС «Академик Мстислав Келдыш» в Карском море (сентябрь–октябрь 2007 г.), организованных Институтом океанологии им. П.П. Ширшова РАН. Участник научно-исследовательских экспедиций на территории Карелии, Среднего Поволжья, Западной Сибири, Прибайкалья, Швейцарии, Китая, Японии (1996–2012 гг.).

В качестве приглашенного ученого работал в следующих зарубежных организациях:

2012 г. (сентябрь) – приглашенный лектор в Universitá degli studi di Padova (Padua, Italy).
2011 г. (ноябрь) – проведение курса лекций и практических занятий в University of Neuchȃtel (Switzerland) в рамках совместного гранта по программе Scientific and Technological Cooperation between Switzerland and Russia (Université de Genève).
2011 г. (август) – приглашенный лектор в Annamalai University (Tamil-Nadu, India).
2010 г. (апрель) – приглашенный лектор в Institute of Hydrobiology of Chinese Academy of sciences (Wuhan, China).
2010 г. (февраль) – проведение исследований по проекту “Morphology and systematics of the testate amoebae genus Difflugia: critical analysis of testate amoebae collections in the Natural History Museum” (London, UK), осуществленному в рамках финансовой поддержки по гранту Royal Society (International Travel Grant Scheme).
2009 г. (октябрь–ноябрь) – приглашенный лектор в Universitá degli studi di Padova (Padua, Italy).
2009 г. (сентябрь–октябрь) – проведение исследований по теме "Biogeography and biodiversity of free-living microorganisms: a study of testate amoebae (Protozoa) as model organisms" в качестве приглашенного ученого в University of Neuchȃtel (Switzerland) в рамках совместного гранта по программе Scientific and Technological Cooperation between Switzerland and Russia (Université de Genève).
2008 г. (октябрь–ноябрь) – проведение курса лекций и практических занятий в Universitá degli studi di Padova (Padua, Italy).
2008 г. (апрель–май) – проведение исследований в качестве приглашенного исследователя в Ocean University of China (Qingdao, China) в рамках совместного гранта, предоставленного Natural Science Foundation of China (NSFC).

5 сентября 2013 г. на заседании ученого совета ПГУ проректор университета по международной деятельности, профессор Юрий Мазей стал кандидатом в члены корреспонденты Российской академии наук.
За заслуги в области науки и образования удостоен стипендии Губернатора Пензенской обл. (2002 г.),
медали Российской академии наук (РАН) для молодых ученых (2008 г.).
В 2010 г. награждён Почётным знаком «Отличник качества»,
в 2012 г. – Почетной грамотой Министерства образования и науки РФ и Благодарственным письмом Губернатора Пензенской обл.

Среди выступлений на конференциях:

2012, Rome (Italy). XXIX National Congress of the Italian Society of Protistology. Invited lecture: Testate amoebae communities in soils: from point to global scale.
2009, Montbéliard (France). V International Symposium on Testate Amoebae. Plenary lecture: Testate amoebae and landscapes: do tiny organisms reflect macro-environmental patterns? A case from forest-steppe region (Russia).
2007, Dehli (India). International Symposium on Ciliate Biology. Plenary lecture: Changes of psammophilous ciliate community structure during 16-th year period in the White Sea estuary
2006, Antwerp (Belgium). IV International Symposium on Testate Amoebae. Plenary lecture: Community structure of testate amoebae in Russian Sphagnum bogs at different scales.
2004, Sopot (Poland). International Conference “The role of biodiversity in simple, physically driven ecosystems with special focus on sandy sediments”. Invited lecture: Psammophilous ciliate community structure in the estuary: species composition patterns and mechanisms of formation.

По состоянию на декабрь 2012 г. имеет 246 публикаций, в том числе 2 монографии, 3 главы в коллективных монографиях, 27 статей в международных рецензируемых журналах на английском языке, 58 статей в центральных российских рецензируемых журналах (из них 18 переведены на английский язык издательством Pleiades Publishing), 33 статьи в региональных рецензируемых журналах, 3 учебно-методических пособия, 120 тезисов докладов на конференциях различного уровня).

Среди публикаций:

Мазей Ю.А., Цыганов А.Н. Пресноводные раковинные амебы. М.: Товарищество научных изданий КМК, 2006. 300 с.
Стойко Т.Г., Мазей Ю.А. Планктонные коловратки пензенских водоемов. Пенза: Изд-во ПГПУ, 2006. 135 с.
Mazei Yu.A. Biodiversity patterns in protozoan communities: linking processes and scales // Protistology. 2008. Vol. 5. №4. P. 268–280.
Mazei Yu., Gao Sh., Warren A., Li L., Li J., Song W., Esaulov A. Reinvestigation of the marine ciliate Trachelocerca ditis (Wright, 1982) Foissner and Dragesco, 1996 (Ciliophora, Karyorelictea) from the Yellow Sea and an assessment of its phylogenetic position inferred from the small subunit rRNA gene sequence // Acta Protozoologica. 2009. Vol. 48. №3. P. 213–221.
Heger T, Booth R., Sullivan M., Wilkinson D., Warner B., Asada T., Mazei Yu., Meisterfeld R., Mitchell E.A.D. The re-discovery of Nebela ansata: a forgotten microbe illustrates the knowledge gap between microbial and visible biodiversity // Journal of Biogeography. 2011. Vol. 38. P. 1897–1906.
Xu., Esaulov A., Lin X., Mazei Yu., Hu X., Al-Rasheid K.A.S, Warren A. Morphological Studies on Five Trachelocercids from the Yellow Sea coast of China, with a Description of Tracheloraphis huangi spec. nov. (Ciliophora, Karyorelictea) // Acta Protozoologica. 2011. Vol. 50. P. 205–218.
Fournier B., Malysheva E., Mazei Yu., Moretti M., Mitchell E.A.D. Toward the use of Testate Amoebae functional traits as indicator of floodplain restoration success // European Journal of Soil Biology. 2012. Vol. 49. P. 85–91.
Azovsky A.I., Mazei Yu.A. Do microbes have macroecology? Large-scale patterns in diversity and distribution of marine benthic ciliates // Global Ecology and Biogeography. 2013. (online first) DOI: 10.1111/j.1466-8238.2012.00776.x

www.penzainform.ru/news/social/2013/09/06/penzenskij_uchenij_stal_kandidatom_v_chleni-korrespondenti_ran.html
www.rektorat.pnzgu.ru/mazei
www.famous-scientists.ru/10800/