Родом из смоленских дворян Гедеоновых, брат смоленского губернатора, зять сенатора АФ. Талызина, отец д.т.с. А.М. Гедеонова.
С юных лет состоял на службе, после 20 лет военной службы перевелся на гражданскую.

К 1790 году полковник, бригадир с 2.09.1793, генерал-майор с 1797.

С 13 марта по 12 декабря 1796 г. правитель Пензенского наместничества.
С 12.12.1796 по 27.04.1797 первый гражданский губернатор Пензенской, потом Саратовской губернии.
С 27 апреля 1797 по февраль 1798 гражданский губернатор Тульской губернии.
Непродолжительное правление Пензенской губернией не оставило после себя следов, хотя он и требовал от городской думы навести порядок и вычинить ветхие мосты и здания.

26 ноября 1792 г. награжден орденом Святого Георгия 4 степени.

«Гедеонов был человек добрый, не завязчивый и отнюдь не хитрый; служа в армии, он имел во нраве вспыльчивость, которая должна служить отличительным свойством офицера» - так отзывался о Михаиле Яковлевиче вице-губернатор И.М. Долгоруков

http://owiki.ru/wiki/