В 1967 г. - окончил с отличием физико-математический факультет пединститута

После окончания института работает в нем, начав свой путь с должности ассистента.
В 1975 году защитил диссертацию на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук, в 1977 году ему присвоено ученое звание доцента, в 1992 году – ученое звание профессора.

В 1993 году избран действительным членом Международной Академии информатизации.
С 1998 года избран действительным членом Международной Академии педагогического образования. Его научные интересы связаны с исследованиями в актуальном направлении современной физики «Твердотельные широкополосные и узкополосные СВЧ-усилительные системы», в области внедрения информационных технологий в учебный процесс вузов и средних учебных заведений.

В 1977 году А.Ю.Казаков назначен на должность декана физико-математического факультета и проработал в этой должности 9 лет.
С 1985 года заведует кафедрой общей физики.
В декабре 1989 года избран ректором института. В должности ректора проработал до 2009 года.

Сочинения:
• Введение в основы автоматики и информатики. Пенза, 1991.
• Диалог с компьютером. Пенза, 1992.
• Теория и практика автоматизации учебного процесса. Ч. 1, 2. Пенза, 1993.
• Лекции по квантовой физике. Пенза, 1998.

• Знак «Отличник народного просвещения» (1985);
• Орден Дружбы (1996);
• Благодарность Президента Российской Федерации (1996);
• Нагрудный знак «Почётный работник высшего профессионального образования Российской Федерации» (1997);
• Медаль К. Д. Ушинского (1999);
• Медаль «За заслуги в проведении Всероссийской переписи населения» (2002);
• Почётная грамота Министерства образования Российской федерации;
• Почётная грамота губернатора Пензенской области (2005);
• Архиерейская благословенная грамота архиепископа Пензенского и Кузнецкого (2005);
• Титул «Ректор года» (2005);
• Международная награда имени Сократа Европейской Ассамблеи Бизнеса (2006),
• Орден имени А. С. Макаренко Академии поддержки развития образования (2008).

За время руководства А.Ю.Казакова в университете были созданы 5 новых факультетов, открыто 18 новых кафедр, 20 новых специальностей. Университет стал одним из крупных и престижных высших учебных заведений города и региона.

Женат

Спорт, охота, рыбалка, литература.